MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Melissococcus plutonius DAT561 plasmid 1

Total Repeats: 1750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018265	ATTG	2	8	159303	159310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_018265	A	6	6	159314	159319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_018265	T	6	6	159347	159352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_018265	TTA	2	6	159357	159362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_018265	ATT	2	6	159368	159373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_018265	T	6	6	159408	159413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_018265	TAAA	2	8	159422	159429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_018265	ATA	2	6	159470	159475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_018265	TAA	2	6	159516	159521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_018265	A	7	7	159538	159544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_018265	TTTTA	2	10	159565	159574	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_018265	TTTA	2	8	159593	159600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_018265	ATT	2	6	159615	159620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_018265	TAAA	2	8	159664	159671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_018265	TAAA	2	8	159698	159705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_018265	TTCA	2	8	159729	159736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_018265	A	6	6	159740	159745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_018265	TTAA	2	8	159817	159824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_018265	AT	3	6	159861	159866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_018265	TCTT	2	8	159885	159892	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_018265	TTAA	2	8	159908	159915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_018265	TTTG	2	8	159953	159960	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_018265	TAT	2	6	159980	159985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_018265	AAT	2	6	160007	160012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_018265	AAAT	2	8	161702	161709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_018265	T	7	7	161748	161754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_018265	TA	3	6	161800	161805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_018265	TTA	2	6	161806	161811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_018265	TTC	2	6	161819	161824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_018265	CTAT	2	8	161832	161839	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1531	NC_018265	CTT	2	6	161857	161862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_018265	AT	3	6	161879	161884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_018265	ATT	2	6	161984	161989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_018265	T	6	6	161988	161993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_018265	TGA	2	6	162003	162008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_018265	TTC	2	6	162035	162040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_018265	ATA	2	6	162070	162075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_018265	ATA	2	6	162107	162112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_018265	GGTA	2	8	162147	162154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_018265	TCA	2	6	162353	162358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_018265	TA	3	6	162374	162379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_018265	ATC	2	6	162406	162411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_018265	TTA	2	6	162429	162434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_018265	ACTC	2	8	162451	162458	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_018265	TAC	2	6	162463	162468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_018265	AATC	2	8	162479	162486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_018265	CAT	2	6	162519	162524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_018265	ATT	2	6	162542	162547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_018265	TCT	2	6	162586	162591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_018265	TC	3	6	162599	162604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_018265	ATA	2	6	162654	162659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_018265	TTG	2	6	162674	162679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_018265	T	6	6	162689	162694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_018265	T	6	6	162714	162719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_018265	ATT	2	6	162742	162747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_018265	T	7	7	162771	162777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_018265	A	6	6	162800	162805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_018265	A	6	6	162821	162826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_018265	T	6	6	162836	162841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_018265	ATTT	2	8	162855	162862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_018265	ATA	2	6	162866	162871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_018265	CAATA	2	10	162880	162889	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1564	NC_018265	A	6	6	162940	162945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_018265	TAA	2	6	162948	162953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_018265	GAG	3	9	163727	163735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_018265	A	6	6	165553	165558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_018265	T	7	7	165562	165568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_018265	ATT	2	6	165588	165593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_018265	ATTT	2	8	165615	165622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_018265	T	6	6	165626	165631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_018265	TA	3	6	165645	165650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_018265	TAA	2	6	165663	165668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_018265	ATG	2	6	165674	165679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_018265	ATT	2	6	165693	165698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_018265	AT	3	6	165739	165744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_018265	TAA	2	6	165748	165753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_018265	ATA	2	6	165758	165763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_018265	ATA	2	6	165767	165772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_018265	A	7	7	165784	165790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_018265	TAT	2	6	165795	165800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_018265	TTA	2	6	165803	165808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_018265	ATA	2	6	165822	165827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_018265	GAAC	2	8	165871	165878	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1585	NC_018265	TATT	2	8	165883	165890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_018265	T	6	6	173772	173777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_018265	A	6	6	173778	173783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_018265	ATA	2	6	173803	173808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_018265	TTA	2	6	173864	173869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_018265	T	7	7	174929	174935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_018265	TAA	2	6	175497	175502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1605	NC_018265	CATG	2	8	175517	175524	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_018265	A	8	8	175559	175566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_018265	T	6	6	176701	176706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_018265	TTA	2	6	176716	176721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_018265	ATA	2	6	176722	176727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_018265	TTA	2	6	176741	176746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_018265	AAT	2	6	176767	176772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_018265	AT	3	6	176778	176783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_018265	TA	3	6	176796	176801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_018265	A	6	6	176801	176806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_018265	TCTA	2	8	176813	176820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_018265	T	7	7	176848	176854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_018265	TA	3	6	176863	176868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1621	NC_018265	ACAA	2	8	178142	178149	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_018265	TGCT	2	8	179502	179509	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_018265	ATG	2	6	179510	179515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1625	NC_018265	TAA	2	6	179562	179567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_018265	ATT	2	6	179612	179617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1630	NC_018265	TCA	2	6	181980	181985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1635	NC_018265	TTAAA	2	10	182047	182056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_018265	T	6	6	182079	182084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_018265	TA	3	6	182088	182093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_018265	TTAA	2	8	182123	182130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_018265	T	6	6	182133	182138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.